樟科植物作為常見的重要經(jīng)濟林木,在林業(yè)、輕工、醫(yī)藥等領(lǐng)域都占有重要的地位,大多數(shù)種類集中分布于長江以南各省區(qū),然而對其物種的把握與識別卻始終是困擾大家的一個難題,阻礙了對其實施有效的生物多樣性保護與開發(fā)利用。物種的準確鑒定是一切生產(chǎn)、應(yīng)用與研究至關(guān)重要的第一步,DNA條形碼技術(shù)的應(yīng)用,使得前述難題都有方法可循。
為了探尋與評估DNA條形碼技術(shù)對這一難題的解決能力,中國科學院西雙版納熱帶植物園植物系統(tǒng)發(fā)育與保護研究組研究員李捷指導的博士研究生劉志芳和慈秀芹利用該研究組在樟科植物分類與系統(tǒng)學方面近二十年的研究與積累,將DNA條形碼技術(shù)與樟科形態(tài)學特征相結(jié)合,分別從條形碼的鑒定能力、物種糾錯能力和系統(tǒng)演化等三個方面進行了分析與探討。研究發(fā)現(xiàn),國際條形碼組織推薦的核心條形碼matK和rbcL與補充條形碼trnH-psbA、ITS和ITS2,除對基部的部分類群有好的鑒定表現(xiàn)外,整體上對樟科植物的物種鑒定能力較弱;但是條形碼ITS,如果不考慮序列的擴增與測序困難問題,其鑒定能力最佳,推薦作為樟科植物的有力條形碼;條形碼技術(shù)與形態(tài)鑒定相結(jié)合,對樟科物種鑒定糾錯率高達10.8%;條形碼數(shù)據(jù)可以一定程度地重建樟科植物的系統(tǒng)演化。此項研究對林業(yè)、輕工、醫(yī)藥領(lǐng)域利用樟科植物資源具有較高的參考價值,對樟科植物的分類與系統(tǒng)發(fā)育研究以及種質(zhì)資源保護也有重要的意義,同時該研究也為正在開展的東南亞等地區(qū)樟科植物調(diào)查提供了數(shù)據(jù)參考。
研究結(jié)果以DNA Barcoding Evaluation and Implications for Phylogenetic Relationships in Lauraceae from China 為題發(fā)表于PLoS ONE 。該研究得到NSFC (31370245, 31500454)和MOST (2011FY120200–4,2012FY110400)基金的資助,以及中科院東南亞生物多樣性研究中心(Y4ZK111B01)的資助。
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