蕨類葉綠體基因組學(xué)研究再獲進(jìn)展

2011-04-19 09:40:38         來(lái)源:武漢植物園     瀏覽次數(shù):

  中科院武漢植物園高磊博士等人在王艇研究員指導(dǎo)下,發(fā)現(xiàn)蕨類葉綠體基因組的進(jìn)化動(dòng)態(tài)遠(yuǎn)比以往設(shè)想的更為復(fù)雜。研究結(jié)果已于4月13日發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)刊物BMC  Plant  Biology。

  武漢植物園在前期的研究中測(cè)定了我國(guó)首個(gè)蕨類植物葉綠體基因組全序列(BMC  Evolutionary  Biology,  2009,  9:130),并注意到位于蕨類葉綠體基因組大單拷貝區(qū)的rpoB和psbZ間區(qū)(BZ區(qū)),其基因順序可歸為兩類:一是以觀音座蓮和松葉蕨為代表的祖先型,即座蓮型;一是以桫欏和鐵線蕨為代表的衍生型,稱為鐵線蕨型。分析認(rèn)為,從座蓮型到鐵線蕨型的轉(zhuǎn)變可能是借助兩條進(jìn)化途徑、依靠?jī)纱尾糠种丿B的倒位得以實(shí)現(xiàn),但是對(duì)該結(jié)構(gòu)性重組的具體進(jìn)化過(guò)程尚不了解。

  為解決此問(wèn)題,武漢植物園高磊博士等人在王艇研究員指導(dǎo)下,以BZ區(qū)為對(duì)象,對(duì)涵蓋現(xiàn)存蕨類所有11個(gè)目的植物進(jìn)行了測(cè)序和進(jìn)化基因組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)除樹(shù)蕨類、水龍骨類和異孢蕨類組成的核心薄囊蕨以外,所有其他蕨類均表現(xiàn)為座蓮型;而絕大多數(shù)核心薄囊蕨類則擁有鐵線蕨型。出乎意料的是,樹(shù)蕨類華東瘤足蕨(Plagiogyria  japonica)的基因順序(瘤足蕨型)與前二者均不相同,有可能是在鐵線蕨型基礎(chǔ)上再發(fā)生一次小型回復(fù)倒位所致。在膜蕨類的南海瓶蕨(Vandenboschia  radicans)和木賊類的問(wèn)荊(Equisetum  arvense)及節(jié)節(jié)草(Equisetum  ramosissimum)的trnY-trnE基因間區(qū)(YE-IGS)中觀察到有大量重復(fù)序列存在。南海瓶蕨的YE-IGS含17個(gè)高度相似、大小為27  bp的串聯(lián)重復(fù);它們與相鄰的trnY-GUA基因的反密碼子區(qū)同源,并都能形成類似的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。問(wèn)荊和節(jié)節(jié)草的YE-IGS極度擴(kuò)張至5kb,擁有上百個(gè)可形成莖環(huán)二級(jí)結(jié)構(gòu)的散布重復(fù),其序列組成和結(jié)構(gòu)也同鄰近trnY的反密碼子區(qū)高度同源。
 

編輯:vivian

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